琴苏醒后竭力将x教授排出自己的意识。随后遵循自己意识中的呼唤，前去自己曾经的家。x教授直呼大事不妙，于是带着众人前去拦截。
琴回到自己曾经的家，却在这里见到了自己“已故”的父亲。原来当年琴的父亲在那场车祸中并没有死去!被自己女儿的超能力深深震慑到的父亲抛弃了琴，将琴托付给了查尔斯教授。
查尔斯教授为了不让童年的惨痛经历以及被父亲抛弃的真相影响到琴于是在她脑中植入了“父母在车祸中双亡”的意识，用以保护琴。这就是琴脑海中的“意识防火墙”。但现在她突破了这层墙，自己发现了真相。
对自己害母亲死亡、被父亲抛弃、被查尔斯教授欺骗，同时拥有了一个自己不能掌控并且时常失控的巨大能量，琴陷入了极深的痛苦与困惑之中。
这时，x战警众人赶到，查尔斯教授试图安抚琴。但这时警车不合时宜的开到现场，被警笛声弄得心烦意乱的琴再次失控，释放能量掀翻了警车。
蓝恶魔见状，瞬间移动上去想阻止琴，但被琴用能力操纵墙壁砸了过来。快银也冲了上去，但没想到琴的意念力比他速度还快，被甩到了一边重伤倒地。
这时魔形女走了出来，继续安抚琴。但琴再一次失控放出巨大的冲击波，将魔形女撞到了裸露的钢筋上，直接刺穿身体死亡。琴再也受不自己了，于是赶忙飞离了现场。x战警则带着魔形女的尸体和重伤的快银回到了基地。
琴来到了一处庄园。在这里见到了另一支变种人的领袖——万磁王。万磁王看到了琴身上的血迹，一直逼问琴那到底是谁的血迹。
这时军方的人乘两架直升机赶到这里，要求万磁王交出琴。万磁王拒绝了他，但这时琴却自己从屋中走了出来。
琴用意念力直接摧毁了一架军方来时乘坐的飞机，并且还想摧毁第二架。万磁王不想让琴滥杀无辜，于是用自己的磁力对抗琴的意念力，拼尽全力将飞机中军方的人悉数救出。
见琴惹了事，万磁王很生气于是驱逐了琴。琴这下得罪了查尔斯教授与万磁王两支变种人和人类，孤立无援。
在酒吧中，化装成女探员的德巴力人找到了正在买醉的琴，她告诉琴她不是一般人，她不会被这种能量吓到，她能够帮助琴。于是琴信以为真，和她来到了位于纽约的德巴力人总部。
在这里女探员德巴力人向琴展示了这种能量的渊源。这种能量是宇宙之中一种强大、纯粹、被称为“凤凰之力”的能量。这种能量很强，所到之处灰飞烟灭。
德巴力人的母星就是被凤凰之力摧毁的。而流落到地球的德巴力人则是追踪到凤凰之力的信号后，来到这里研究如何驾驭这股力量的，然后再用这股力量东山再起的。
凤凰之力来到地球，不是偶然，而是琴的与众不同的体质吸引凤凰之力来此的，琴会注定吸收凤凰之力。德巴力人继续蛊惑琴，让琴与自己为伍，而与查尔斯教授、万磁王等人划清界限。琴信以为真，傻傻上钩。
在x战警基地内，痛失女友魔形女的野兽对琴恨之入骨，于是他擅自驾驶飞船来到了万磁王的庄园，将琴杀了魔形女的事告诉了万磁王。万磁王这下知道琴衣服上的血迹是谁的了。
x战警中，是查尔斯教授、万磁王、魔形女三人最开始召集各路变种人，四处为变种人的利益奔走，才有了今天的规模。
这三人之间有着非比寻常的情谊，因此得知老战友魔形女被杀，万磁王怒火攻心，带上自己标志性的头盔，带上小弟，与野兽一起前去纽约准备杀琴。
而查尔斯教授一边，也感知到了琴在纽约，但查尔斯教授始终坚信琴是善良的，他希望能将琴劝说回来，于是带上x战警众人也前去纽约找琴。就这样，三路人马会师纽约。
在纽约德巴力人的秘密总部前，万磁王等人遇到了查尔斯教授等人。万磁王与野兽一心想冲进去杀了琴，x战警众人则奋力阻止他俩。
众人打作一团。见双方打的难舍难分，万磁王放了个大招，将地下的一辆地铁拉了出来，封住了道路，阻止了x战警众人。自己则进入房子，见到了琴。
万磁王将屋内的金属扶手变成长矛，想刺死琴，但琴轻松化解了长矛的攻击。琴用意念力将万磁王拉到空中，将他标志性的头盔碾成碎片，然后将万磁王丢出了屋子。
查尔斯教授此时进来了，他仍在劝说琴，但琴在德巴力女探员的蛊惑下根本听不进去，她碾坏了查尔斯教授的轮椅，用意念力像提线木偶一样的操控着查尔斯教授一步一步的走到她的面前。
为了让琴知道真相，查尔斯教授放弃了心理防线，让同样具有心灵感应力的琴进入他的意识，看看他的脑海。在查尔斯教授的脑海中，琴看到了虽然查尔斯教授欺骗了自己，但他也确实真心想帮助琴。
琴被感动了，立场开始动摇。德巴力女探员赶紧上前蛊惑琴，让琴放弃凤凰之力。琴同意了于是女探员开始吸收琴的凤凰之力。在女探员吸的正爽的时候，她一不小心把要消灭地球人的计划说漏嘴了。
这时镭射眼赶来，一炮击飞了女探员，救下了琴。但这时人类的特殊部队赶到，将现场所有变种人包括琴，全部戴上枷锁，送上一辆特制列车，押送至特制监狱进行收监。
尝到了凤凰之力甜头的德巴力人不愿这样放弃凤凰之力，于是，一群德巴力人开始进攻列车。德巴力人是外星生物，具有自愈能力，身手又敏捷，人类的武器对他们根本没用。
人类守军纷纷败退。情急之下，最后的守军不得已，打开了变种人身上的枷锁，于是查尔斯教授麾下的x战警与万磁王麾下的变种人结成抗敌统一战线，协力对抗德巴力人。